Le CLA est un excellent complément alimentaire pour éliminer la masse grasse. Il est d’ailleurs le stimulant de perte de graisse le plus privilégié des bodybuilders pendant la période de sèche. La consommation de CLA est donc indispensable pour les pratiquants de musculation même s’il faut croire que sa consommation a des effets secondaires sur le corps. Les effets indésirables connus sont les troubles gastro-intestinaux, la résistance à l'insuline, la fatigue, l’augmentation du taux de glycémie chez les diabétiques. Certaines formes de CLA peuvent aussi réduire le taux de bon cholestérol (HDL). Mais quoi qu'il en soit, il s'agit d'effets qui apparaissent seulement chez certaines personnes et ces effets ne se manifestent pas tous chez une même personne.
Le plus souvent, le complément alimentaire à base de CLA est obtenu par transformation de l'acide linoléique qu’on trouve dans les huiles de soja, de tournesol et de carthame. Il est nécessaire de connaitre s’il contient des isomères c9, t11. L’acide linoléique conjugué de type « trans-10, cis-12 » a tendance à augmenter le mauvais cholestérol et à créer une résistance à l'insuline. Le CLA qui contient uniquement du «trans-10, cis-12» a également un impact négatif sur le diabète. C’est notamment le cas chez les personnes souffrant d'obésité de diabète.
Une étude récente associe par ailleurs la consommation de CLA à une détérioration de la souplesse des artères, mais cela mérite encore d’autres études concluantes avant de statuer. Cependant, le CLA ne constitue pas un grand danger pour le corps à condition de bien surveiller le dosage par jour. Et il est aussi nécessaire de vérifier la fiabilité et la qualité du produit pour éviter les effets secondaires.